De manera libre los indígenas deben poder tomar la mejor decisión sobre las medidas del Gobierno que pudieran poner en riesgo sus derechos fundamentales: la libre determinación como expresión de su autonomía, integridad de sus tierras y territorios, y la preservación de su hábitat.
Las comunidades indígenas presentaron una demanda de juicio de amparo contra su construcción ya que el Estado mexicano violó el proceso de consulta previa al no respetar el Convenio 169 de la Organización Internacional del Trabajo (OIT) y los estándares internacionales. Los pueblos indígenas piden respeto a su autonomía y libre determinación, y también reclaman por su integridad física, moral y psicológica.
El amparo fue otorgado por la jueza segunda de Distrito de Amparo y Juicios Penales Federales del estado de Chiapas a pobladores de Palenque, Salto de Agua y Ocosingo
Una suspensión definitiva concedida a comunidades indígenas de Chiapas puso freno a cualquier obra nueva relacionada con el Tramo 1 del Tren Maya.
Esta situación fue el eje de la demanda y en ese sentido, la jueza les dio la razón a los habitantes, pues consideró que los trabajadores de la obra podrían ocasionar contagios de COVID-19.
